Факультет был создан в 2016 году на базе военного института Сил воздушной обороны имени дважды Героя Советского Союза Талгата Бегельдинова. Лейтенанты медицинской службы проходили обучение по учебной программе интернатуры Западно-Казахстанского медуниверситета им. М.Оспанова с параллельной клинической практикой на базах медицинских учреждений Актобе.

- В этом году закончили 15 интернов. В следующем году планируем выпустить еще 23 интерна, - рассказал Кайрат Даркулов, начальник кафедры военной медицины, полковник. – По специальности они хирурги, терапевты и врачи общей практики. Сейчас распределяются по всем частям министерства обороны. Будут работать в медпунктах, госпиталях. 

- Я хотел стать врачом, это детская мечта, - рассказал 24-летний лейтенант Адлет Искаков. – Повзрослел и решил, что стать военным врачом перспективнее, карьерный рост. И считаю, что служить Родине долг каждого мужчины. По специальности я врач общей практики. Учеба давалась легко.

Лейтенат Елнур Жамбырбай приехал на обучение в Актобе из столицы. 

- Я решил стать военным врачом из патриотизма и это была мечта моего деда, - рассказал Елнур. – Он мне посоветовал поступать. 

 В этом году военный вуз готов принять на обучение 25 будущих военврачей.